Operace kochleárního implantátu trvá přibližně 2 – 3 hodiny.

Riziko při kochleární implantaci je malé, srovnatelné s jinými ušními operacemi. Pacienti i jejich rodinní příslušníci nemusí mít obavy. Operace provádějí zkušení chirurgové na špičkově vybavených pracovištích.
Průběh operace v bodech:
- Operuje se v celkové anestezii.
- Oholí se vlasy v místě řezu.
- Řezem se vytvoří kapsa pro vložení implantátu.
- V kosti za uchem se dále vytvoří lůžko pro uložení pouzdra implantátu a elektrodového svazku.
- Vytvoří se přístup do hlemýždě.
- Do hlemýždě se zasune elektrodový svazek.
- Elektrodový svazek a pouzdro implantátu se zafixují proti uvolnění (na obrázku jedna z variant zafixování pouzdra implantátu - fixace 1 stehem).

- Před uzavřením operační rány se ověří funkčnost implantátu (telemetrická měření impedance a další testy). Po probuzení cítí pacient lehký diskomfort, podle potřeby se podávají léky tišící bolest.
- Pacient vstává z lůžka již druhý den, délka pobytu v nemocnici je rozdílná, závisí na místních zvyklostech a pohybuje se od jednoho do několika dní.